Les frères sont de retour dans une toute nouvelle aventure en haute mer. Voguez vers l'île Shipland avec Mario et Luigi (mi-bateau, mi-île) et parcourez le vaste monde de Concordia Propulsez-vous avec le canon de Shipshape pour visiter, explorer et accomplir des missions dans les îles qui comptent des forêts tropicales et des villes animées Rencontrez de nouveaux amis en cours de route, comme Connie et Snoutlet (assurément pas un cochon) et retrouvez des visages familiers du Royaume Champignon comme Peach et Bowser, qui pourraient vous aider, ou vous nuire, pendant votre aventure